Masyw Niżnych Tatr zaraz po Tatrach Wysokich jest najważniejszym obszarem chronionym Słowacji.   Centralna część pogórza uformowana została ze skał krystalicznych – granitu, granodiorytu, gnejsu i filitu, pod wpływem działalności lodowca. Zróżnicowana struktura geologiczna Niżnych Tatr obejmuje także duże obszary krasowe - system Demänovských jaskiń (narodowy pomnik przyrody) rozpościera się na dziewięciu poziomach i ma długość 24 kilometrów. Obszar Tatr Niżnych w 90% pokrywają lasy, w tym także liściaste – dębowo-bukowe. Wśród chronionych gatunków warto wymienić szarotkę alpejską, kilka rodzajów skalnic, sasankę słowacką. Niżne Tatry są jedynym miejscem na Słowacji gdzie możemy spotkać Saxifraga Mutata L i zmienkę górską.